在工业领域，厌氧塔反应器发挥着重要作用。食品饮料行业的啤酒厂、饮料厂、罐头厂等，其废水中富含糖类、蛋白质、脂肪等大量有机物，厌氧塔能高效降解这些物质，大幅降低废水的 COD 和 BOD 含量，且处理过程中产生的沼气可回收利用，实现环保与资源回收双赢。​

制药行业的废水成分复杂，含有多种有机污染物和药物残留，毒性较大。厌氧塔通过厌氧微生物的代谢作用，将这些难降解的有机物分解转化，降低废水的毒性，为后续的好氧处理等工艺创造有利条件，保障制药废水的达标排放。​

印染行业的废水具有颜色深、有机物含量高、成分复杂等特点，其中的染料和助剂等物质难以生物降解。厌氧塔在处理印染废水时，不仅能去除部分有机物，还能对染料起到一定的脱色作用，提高废水的可生化性，减轻后续处理工艺的负担，助力印染企业实现绿色生产。​

在市政污水处理方面，厌氧塔反应器可有效处理城市生活污水中的有机物和部分营养物质。它能将污水中的有机污染物转化为沼气和生物污泥，沼气可作为清洁能源用于发电或供热，生物污泥经处理后可作为肥料等资源化利用，既减少了生活污水对环境的污染，又实现了能源和资源的回收。

​农业领域也是厌氧塔反应器的重要应用场景。畜禽养殖行业产生的废水中含有大量的粪便、尿液等，有机物浓度极高，若直接排放会对环境造成严重污染。厌氧塔能高效处理这类废水，降解其中的有机物，降低污染负荷，同时产生的沼气可满足养殖场的部分能源需求，实现废物资源化。​

对于农村生活污水，厌氧塔反应器同样适用。随着农村生活水平的提升，生活污水排放量逐年增加，厌氧塔可根据农村污水量小、分散的特点，进行就地处理，减少污水收集和运输成本，处理后的出水可用于农田灌溉等，推动农村水环境的改善和生态保护。​